בגינות שסבלו מהזנחה מתמשכת, ממזיקים, או שניזוקו במהלך שיפוצי הבית וכדומה, מומלץ לבצע הליך שיקום טרם המעבר לתחזוקה שוטפת.
בשיקום נכללים, בין היתר:
החלפת צמחייה, ביצוע שינויים ותיקונים במערכת ההשקיה, ריסוס נגד מזיקים, דישון ממוקד ומרובה, החלפה או הוספה של אדמה ו/או חיפוי מסוג אחר.
הטיפול המשקם יכול לכלול את הגינה כולה, או חלקים מסוימים ממנה שסבלו מנזק ספציפי.